Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01725 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01725 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01725 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01725 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01725 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01725 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01725 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01725 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01725 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01725 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01725 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01725 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01725 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01725 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01725 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01725 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01725 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01725 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01725 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01725 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01725 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01725 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01725 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01725 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01725 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01725 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01725 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01725 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01725 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01725 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01725 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01725 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01725 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01725 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01725 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01725 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01725 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01725 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01725 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
P01725 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
P01725 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01725 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01725 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01725 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01725 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01725 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01725 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01725 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01725 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P01725 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P01725 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01725 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01725 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01725 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01725 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01725 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01725 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01725 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01725 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01725 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01725 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01725 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01725 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01725 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01725 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01725 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01725 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01725 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01725 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01725 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01725 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P01725 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01725 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01725 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01725 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01725 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01725 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01725 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01725 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01725 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01725 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01725 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01725 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01725 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01725 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01725 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01725 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01725 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01725 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01725 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01725 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01725 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01725 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01725 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01725 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01725 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01725 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01725 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01725 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms