Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01653 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01653 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01653 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01653 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P01653 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01653 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01653 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01653 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01653 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01653 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01653 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01653 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01653 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01653 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01653 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01653 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01653 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01653 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01653 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01653 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01653 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01653 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01653 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01653 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01653 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01653 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01653 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01653 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
P01653 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01653 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01653 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01653 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01653 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01653 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01653 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01653 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
P01653 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01653 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01653 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01653 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01653 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01653 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01653 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01653 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01653 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01653 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01653 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01653 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01653 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01653 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01653 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01653 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01653 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01653 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
P01653 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
P01653 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01653 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01653 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01653 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01653 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01653 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01653 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01653 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01653 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01653 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
P01653 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01653 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01653 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01653 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01653 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01653 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01653 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01653 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01653 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01653 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01653 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01653 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01653 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01653 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01653 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01653 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01653 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01653 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01653 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01653 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01653 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
P01653 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01653 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
P01653 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
P01653 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01653 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01653 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01653 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01653 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01653 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01653 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01653 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01653 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01653 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms