Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01645 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01645 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01645 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
P01645 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01645 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01645 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01645 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01645 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01645 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01645 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01645 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01645 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01645 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01645 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P01645 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01645 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
P01645 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01645 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01645 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01645 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01645 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01645 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01645 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01645 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01645 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01645 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01645 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01645 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
P01645 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01645 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01645 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01645 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01645 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01645 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01645 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01645 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01645 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01645 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
P01645 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01645 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01645 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01645 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01645 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
P01645 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01645 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
P01645 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01645 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01645 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01645 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01645 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01645 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01645 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
P01645 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01645 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01645 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01645 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01645 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01645 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01645 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01645 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01645 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01645 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01645 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01645 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01645 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01645 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01645 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01645 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P01645 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01645 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01645 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01645 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
P01645 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
P01645 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01645 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01645 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01645 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01645 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01645 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01645 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01645 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
P01645 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01645 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01645 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
P01645 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01645 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01645 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01645 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01645 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01645 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01645 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01645 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01645 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01645 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01645 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01645 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01645 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01645 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01645 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms