Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4bP01029 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
C4bP01029 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4bP01029 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4bP01029 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4bP01029 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C4bP01029 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4bP01029 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4bP01029 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4bP01029 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C4bP01029 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C4bP01029 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C4bP01029 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C4bP01029 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C4bP01029 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
C4bP01029 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C4bP01029 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C4bP01029 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C4bP01029 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C4bP01029 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C4bP01029 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C4bP01029 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4bP01029 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4bP01029 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4bP01029 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4bP01029 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4bP01029 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C4bP01029 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4bP01029 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
C4bP01029 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4bP01029 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4bP01029 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C4bP01029 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4bP01029 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4bP01029 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
C4bP01029 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C4bP01029 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4bP01029 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4bP01029 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4bP01029 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4bP01029 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4bP01029 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4bP01029 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4bP01029 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4bP01029 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C4bP01029 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4bP01029 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C4bP01029 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
C4bP01029 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4bP01029 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4bP01029 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4bP01029 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C4bP01029 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4bP01029 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4bP01029 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4bP01029 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4bP01029 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4bP01029 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4bP01029 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4bP01029 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4bP01029 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4bP01029 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C4bP01029 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4bP01029 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4bP01029 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4bP01029 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4bP01029 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C4bP01029 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4bP01029 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4bP01029 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4bP01029 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4bP01029 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C4bP01029 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4bP01029 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
C4bP01029 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4bP01029 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C4bP01029 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4bP01029 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4bP01029 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4bP01029 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C4bP01029 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C4bP01029 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C4bP01029 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
C4bP01029 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C4bP01029 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C4bP01029 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4bP01029 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4bP01029 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4bP01029 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4bP01029 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4bP01029 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C4bP01029 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C4bP01029 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C4bP01029 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C4bP01029 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C4bP01029 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C4bP01029 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C4bP01029 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C4bP01029 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C4bP01029 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms