Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD1O95696 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD1O95696 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD1O95696 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD1O95696 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD1O95696 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD1O95696 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BRD1O95696 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRD1O95696 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRD1O95696 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BRD1O95696 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD1O95696 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD1O95696 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD1O95696 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD1O95696 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD1O95696 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD1O95696 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD1O95696 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD1O95696 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD1O95696 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD1O95696 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD1O95696 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD1O95696 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD1O95696 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD1O95696 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD1O95696 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD1O95696 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD1O95696 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD1O95696 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD1O95696 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD1O95696 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD1O95696 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD1O95696 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD1O95696 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD1O95696 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD1O95696 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD1O95696 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD1O95696 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD1O95696 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD1O95696 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD1O95696 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD1O95696 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD1O95696 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD1O95696 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD1O95696 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD1O95696 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD1O95696 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD1O95696 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD1O95696 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD1O95696 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD1O95696 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD1O95696 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD1O95696 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD1O95696 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD1O95696 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD1O95696 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD1O95696 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD1O95696 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BRD1O95696 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD1O95696 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD1O95696 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD1O95696 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD1O95696 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD1O95696 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD1O95696 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD1O95696 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD1O95696 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD1O95696 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD1O95696 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD1O95696 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD1O95696 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD1O95696 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD1O95696 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD1O95696 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD1O95696 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD1O95696 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD1O95696 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD1O95696 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD1O95696 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD1O95696 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD1O95696 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD1O95696 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD1O95696 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD1O95696 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD1O95696 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD1O95696 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD1O95696 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD1O95696 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD1O95696 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD1O95696 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD1O95696 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD1O95696 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD1O95696 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD1O95696 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD1O95696 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD1O95696 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD1O95696 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD1O95696 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD1O95696 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD1O95696 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms