Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN7O94888 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN7O94888 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBXN7O94888 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms