Protein–RNA interactions for Protein: O89051

Itm2b, Integral membrane protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2bO89051 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itm2bO89051 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itm2bO89051 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itm2bO89051 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itm2bO89051 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms