Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbbp9O88851 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp9O88851 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp9O88851 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp9O88851 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp9O88851 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp9O88851 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp9O88851 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp9O88851 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp9O88851 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp9O88851 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp9O88851 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp9O88851 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp9O88851 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp9O88851 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms