Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AvilO88398 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AvilO88398 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AvilO88398 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AvilO88398 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AvilO88398 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AvilO88398 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AvilO88398 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AvilO88398 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AvilO88398 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AvilO88398 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AvilO88398 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AvilO88398 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AvilO88398 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AvilO88398 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AvilO88398 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AvilO88398 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AvilO88398 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AvilO88398 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AvilO88398 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AvilO88398 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AvilO88398 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AvilO88398 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AvilO88398 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AvilO88398 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AvilO88398 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AvilO88398 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AvilO88398 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AvilO88398 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AvilO88398 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AvilO88398 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AvilO88398 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AvilO88398 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AvilO88398 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AvilO88398 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AvilO88398 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AvilO88398 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AvilO88398 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AvilO88398 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AvilO88398 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AvilO88398 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AvilO88398 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AvilO88398 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AvilO88398 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AvilO88398 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AvilO88398 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AvilO88398 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AvilO88398 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AvilO88398 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AvilO88398 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AvilO88398 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AvilO88398 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AvilO88398 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AvilO88398 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AvilO88398 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AvilO88398 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AvilO88398 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AvilO88398 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AvilO88398 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AvilO88398 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AvilO88398 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AvilO88398 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AvilO88398 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AvilO88398 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AvilO88398 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AvilO88398 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AvilO88398 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AvilO88398 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AvilO88398 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AvilO88398 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AvilO88398 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AvilO88398 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AvilO88398 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AvilO88398 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AvilO88398 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AvilO88398 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AvilO88398 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AvilO88398 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AvilO88398 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AvilO88398 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AvilO88398 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AvilO88398 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AvilO88398 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AvilO88398 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AvilO88398 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AvilO88398 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AvilO88398 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AvilO88398 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AvilO88398 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AvilO88398 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AvilO88398 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AvilO88398 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AvilO88398 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AvilO88398 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AvilO88398 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AvilO88398 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AvilO88398 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AvilO88398 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AvilO88398 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AvilO88398 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms