Protein–RNA interactions for Protein: O75333

TBX10, T-box transcription factor TBX10, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX10O75333 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX10O75333 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX10O75333 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX10O75333 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX10O75333 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX10O75333 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TBX10O75333 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX10O75333 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX10O75333 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX10O75333 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX10O75333 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX10O75333 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TBX10O75333 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX10O75333 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX10O75333 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX10O75333 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX10O75333 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX10O75333 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TBX10O75333 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBX10O75333 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX10O75333 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX10O75333 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX10O75333 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX10O75333 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX10O75333 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX10O75333 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX10O75333 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX10O75333 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBX10O75333 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX10O75333 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX10O75333 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX10O75333 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX10O75333 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX10O75333 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX10O75333 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX10O75333 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TBX10O75333 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX10O75333 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX10O75333 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX10O75333 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX10O75333 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX10O75333 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBX10O75333 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX10O75333 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX10O75333 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX10O75333 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX10O75333 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX10O75333 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBX10O75333 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX10O75333 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX10O75333 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX10O75333 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX10O75333 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX10O75333 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBX10O75333 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TBX10O75333 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TBX10O75333 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX10O75333 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX10O75333 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX10O75333 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX10O75333 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX10O75333 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX10O75333 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBX10O75333 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX10O75333 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX10O75333 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX10O75333 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX10O75333 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBX10O75333 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX10O75333 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX10O75333 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX10O75333 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX10O75333 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX10O75333 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX10O75333 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX10O75333 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TBX10O75333 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX10O75333 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX10O75333 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX10O75333 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX10O75333 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX10O75333 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBX10O75333 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX10O75333 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX10O75333 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX10O75333 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX10O75333 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX10O75333 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX10O75333 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX10O75333 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX10O75333 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX10O75333 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX10O75333 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBX10O75333 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBX10O75333 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBX10O75333 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBX10O75333 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX10O75333 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX10O75333 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBX10O75333 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms