Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF4O60810 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF4O60810 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF4O60810 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms