Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SELENOFO60613 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SELENOFO60613 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SELENOFO60613 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SELENOFO60613 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SELENOFO60613 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SELENOFO60613 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SELENOFO60613 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms