Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCNT1O60563 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCNT1O60563 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCNT1O60563 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCNT1O60563 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms