Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TDRD6O60522 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD6O60522 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD6O60522 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms