Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZIC3O60481 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZIC3O60481 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZIC3O60481 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZIC3O60481 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms