Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDH7O60245 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDH7O60245 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH7O60245 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms