Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg2O55111 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dsg2O55111 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dsg2O55111 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg2O55111 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg2O55111 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg2O55111 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg2O55111 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg2O55111 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg2O55111 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg2O55111 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg2O55111 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg2O55111 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg2O55111 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg2O55111 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg2O55111 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg2O55111 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg2O55111 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg2O55111 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dsg2O55111 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms