Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TsksO54887 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TsksO54887 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TsksO54887 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TsksO54887 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TsksO54887 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TsksO54887 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TsksO54887 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TsksO54887 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TsksO54887 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TsksO54887 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TsksO54887 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TsksO54887 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TsksO54887 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TsksO54887 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TsksO54887 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TsksO54887 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TsksO54887 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TsksO54887 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TsksO54887 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TsksO54887 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TsksO54887 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TsksO54887 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TsksO54887 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TsksO54887 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TsksO54887 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TsksO54887 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TsksO54887 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TsksO54887 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TsksO54887 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TsksO54887 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TsksO54887 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TsksO54887 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TsksO54887 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TsksO54887 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TsksO54887 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TsksO54887 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TsksO54887 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TsksO54887 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TsksO54887 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TsksO54887 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TsksO54887 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TsksO54887 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TsksO54887 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TsksO54887 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TsksO54887 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TsksO54887 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TsksO54887 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TsksO54887 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TsksO54887 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TsksO54887 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TsksO54887 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TsksO54887 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TsksO54887 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TsksO54887 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TsksO54887 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TsksO54887 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TsksO54887 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TsksO54887 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TsksO54887 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TsksO54887 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TsksO54887 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TsksO54887 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TsksO54887 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TsksO54887 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TsksO54887 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TsksO54887 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TsksO54887 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TsksO54887 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TsksO54887 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TsksO54887 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TsksO54887 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TsksO54887 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TsksO54887 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TsksO54887 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TsksO54887 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TsksO54887 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TsksO54887 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TsksO54887 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TsksO54887 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TsksO54887 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TsksO54887 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TsksO54887 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TsksO54887 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TsksO54887 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TsksO54887 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TsksO54887 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TsksO54887 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TsksO54887 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TsksO54887 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TsksO54887 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TsksO54887 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TsksO54887 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TsksO54887 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TsksO54887 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TsksO54887 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TsksO54887 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TsksO54887 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TsksO54887 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TsksO54887 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms