Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk2a2O54833 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms