Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkaO54804 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ChkaO54804 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ChkaO54804 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ChkaO54804 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkaO54804 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkaO54804 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChkaO54804 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkaO54804 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms