Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXCL13O43927 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL13O43927 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL13O43927 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL13O43927 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL13O43927 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL13O43927 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL13O43927 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL13O43927 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL13O43927 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL13O43927 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL13O43927 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL13O43927 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CXCL13O43927 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL13O43927 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL13O43927 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL13O43927 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL13O43927 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL13O43927 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL13O43927 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL13O43927 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL13O43927 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL13O43927 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL13O43927 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL13O43927 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL13O43927 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL13O43927 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL13O43927 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL13O43927 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CXCL13O43927 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CXCL13O43927 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL13O43927 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL13O43927 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL13O43927 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL13O43927 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL13O43927 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL13O43927 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCL13O43927 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL13O43927 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL13O43927 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms