Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCP110O43303 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCP110O43303 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCP110O43303 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCP110O43303 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCP110O43303 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCP110O43303 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCP110O43303 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCP110O43303 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCP110O43303 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCP110O43303 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCP110O43303 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCP110O43303 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCP110O43303 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCP110O43303 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCP110O43303 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCP110O43303 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCP110O43303 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCP110O43303 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCP110O43303 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCP110O43303 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCP110O43303 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCP110O43303 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCP110O43303 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCP110O43303 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCP110O43303 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCP110O43303 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCP110O43303 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCP110O43303 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCP110O43303 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCP110O43303 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCP110O43303 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCP110O43303 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCP110O43303 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCP110O43303 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCP110O43303 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCP110O43303 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCP110O43303 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCP110O43303 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCP110O43303 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCP110O43303 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCP110O43303 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCP110O43303 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCP110O43303 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCP110O43303 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCP110O43303 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCP110O43303 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCP110O43303 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCP110O43303 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCP110O43303 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCP110O43303 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCP110O43303 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCP110O43303 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCP110O43303 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCP110O43303 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCP110O43303 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCP110O43303 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCP110O43303 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCP110O43303 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCP110O43303 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCP110O43303 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCP110O43303 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCP110O43303 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCP110O43303 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCP110O43303 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCP110O43303 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCP110O43303 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCP110O43303 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCP110O43303 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCP110O43303 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCP110O43303 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCP110O43303 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCP110O43303 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCP110O43303 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCP110O43303 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCP110O43303 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCP110O43303 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCP110O43303 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCP110O43303 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCP110O43303 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCP110O43303 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCP110O43303 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCP110O43303 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCP110O43303 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCP110O43303 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCP110O43303 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCP110O43303 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCP110O43303 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCP110O43303 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCP110O43303 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCP110O43303 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCP110O43303 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCP110O43303 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCP110O43303 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCP110O43303 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCP110O43303 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCP110O43303 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCP110O43303 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCP110O43303 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCP110O43303 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms