Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K13O43283 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K13O43283 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP3K13O43283 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms