Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC7A4O43246 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC7A4O43246 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC7A4O43246 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms