Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kpna6O35345 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kpna6O35345 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Kpna6O35345 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna6O35345 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms