Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srsf5O35326 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Srsf5O35326 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Srsf5O35326 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Srsf5O35326 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Srsf5O35326 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf5O35326 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf5O35326 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf5O35326 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf5O35326 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Srsf5O35326 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms