Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GIPC1O14908 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIPC1O14908 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GIPC1O14908 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms