Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr3O09116 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sprr3O09116 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sprr3O09116 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sprr3O09116 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sprr3O09116 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sprr3O09116 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.6 ms