Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PbsnO08976 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PbsnO08976 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PbsnO08976 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PbsnO08976 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PbsnO08976 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PbsnO08976 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PbsnO08976 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PbsnO08976 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PbsnO08976 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PbsnO08976 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PbsnO08976 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PbsnO08976 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PbsnO08976 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms