Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Flot1O08917 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Flot1O08917 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Flot1O08917 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Flot1O08917 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Flot1O08917 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Flot1O08917 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Flot1O08917 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flot1O08917 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Flot1O08917 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Flot1O08917 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Flot1O08917 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Flot1O08917 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.2 ms