Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Barx2O08686 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Barx2O08686 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Barx2O08686 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Barx2O08686 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Barx2O08686 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Barx2O08686 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Barx2O08686 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Barx2O08686 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Barx2O08686 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Barx2O08686 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Barx2O08686 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barx2O08686 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Barx2O08686 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Barx2O08686 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms