Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3488M0QW81 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3488M0QW81 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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