Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Speer4dL7N216 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Speer4dL7N216 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Speer4dL7N216 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Speer4dL7N216 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms