Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Gm379J3QQ19 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Gm379J3QQ19 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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Gm379J3QQ19 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Gm379J3QQ19 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Gm379J3QQ19 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Gm379J3QQ19 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm379J3QQ19 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Gm379J3QQ19 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Gm379J3QQ19 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm379J3QQ19 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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