Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm2056J3QQ02 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm2056J3QQ02 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms