Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200cJ3QK46 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200cJ3QK46 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms