Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arfip1G5E8V9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfip1G5E8V9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfip1G5E8V9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms