Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Arfgef1G3X9K3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arfgef1G3X9K3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Arfgef1G3X9K3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Arfgef1G3X9K3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.1 ms