Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r167G3UW71 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r167G3UW71 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r167G3UW71 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms