Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NpcdF8VQB8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NpcdF8VQB8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms