Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
5830473C10RikF8VQ07 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
5830473C10RikF8VQ07 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
5830473C10RikF8VQ07 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
5830473C10RikF8VQ07 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms