Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ttc37F8VPK0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ttc37F8VPK0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ttc37F8VPK0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ttc37F8VPK0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttc37F8VPK0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttc37F8VPK0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttc37F8VPK0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttc37F8VPK0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttc37F8VPK0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttc37F8VPK0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttc37F8VPK0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttc37F8VPK0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttc37F8VPK0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttc37F8VPK0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttc37F8VPK0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Ttc37F8VPK0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms