Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmgcF6VRN1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SmgcF6VRN1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SmgcF6VRN1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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