Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf212F6TQD1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf212F6TQD1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms