Protein–RNA interactions for Protein: E9QAA8

Gm4841, Interferon-gamma-inducible GTPase Ifgga3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4841E9QAA8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4841E9QAA8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4841E9QAA8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4841E9QAA8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4841E9QAA8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4841E9QAA8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4841E9QAA8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4841E9QAA8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4841E9QAA8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4841E9QAA8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4841E9QAA8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4841E9QAA8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4841E9QAA8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4841E9QAA8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm4841E9QAA8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm4841E9QAA8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms