Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdh18E9Q9Q6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh18E9Q9Q6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh18E9Q9Q6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh18E9Q9Q6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms