Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20518E9Q548 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms