Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Trappc8E9PWG2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Trappc8E9PWG2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Trappc8E9PWG2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Trappc8E9PWG2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Trappc8E9PWG2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms