Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc17E9PVB5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc17E9PVB5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms