Protein–RNA interactions for Protein: E9PRG8

C11orf98, Uncharacterized protein C11orf98, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf98E9PRG8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf98E9PRG8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf98E9PRG8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf98E9PRG8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms